很多答案的答主毕竟是“学究气”太重，动辄论文发表、引用率、科研经费。
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真相是东京大学与日本国是一个互相成就的关系，而且更多的是日本国成就东京大学。因为日本国是亚洲文化、科技最先进的国家，所以东京大学招收的生源有独特性（类似于中国大陆内部的一线城市的生源），东京大学的毕业生的国内舞台最牛逼。
东京大学的不可撼动的地位，体现在其毕业生在各个领域的成就。
作为一个文学爱好者，我举一个例子，假设新加坡某大学或者香港某大学的文学院挖了几个文学领域的学术大牛，论文发表就是比东京大学文学部（院）的老师强一大截。但是，新加坡某大学毕业生或者香港某大学毕业生里出世界级作家的概率就是远低于东京大学毕业生。
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未来中国大陆也许有某所大学的毕业生在各个领域的表现超过东京大学，但是香港、新加坡两地几乎不可能有一所大学的毕业生达到东京大学毕业生的高度，这是因为日本国这个国家对东京大学的加持会远超香港对港校的加持、新加坡对新加坡某校的加持。
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现在就有一个值得深思的问题，若甲乙两所大学只有文学院。甲大学老师论文发表超过乙大学老师一大截，但是乙大学毕业生出了世界级文学家若干名，准世界级文学家多名。甲大学毕业生世界级文学家挂零蛋，准世界级文学家也几乎没有。
两家大学谁胜谁负？当然是乙大学。毕竟甲大学没有熏陶出一流作家。
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文学只是一个例子，大家也可以看看其它科系毕业生的成就。
千言万语一句话，亚洲第一学府大概率就是亚洲文化、科技最发达的那个国家国内的第一学府。